在第二季中，新任神盾局局长Coulson和他的团队成了“通缉犯”，HYDRA组织仍在追杀他们，而且能够调动的资源已经非常有限，但那不会阻止他们继续为世界的和平与安全而战——毕竟已知的和未知的威胁仍然无处不在。虽然神盾局小组有了新的成员，但……究竟谁才值得信任？ 本季神盾局小组加入了新成员Lan新成员Lanc...e Hunter，他是一名充满阳刚气的雇佣兵神射手，机智灵敏。他不是通过层层选拔进入神盾局的，他的眼中只有钱，因此他帮助神盾局小组的真实动机实在令人生疑。
麦克找到斯凯，将她从监禁中释放了出来。嘉颖要求神盾局的人延长密码的时间，但是没有人愿意投降。亨特和梅寻找芭比，亨特找到芭比，但是沃德在房间里设置了机关。芭比用自己的身体挡住了枪口。沃德杀了梅却发现
嘉颖杀了罗伯特，她拿罗伯特的枪朝自己开了一枪，她出去告诉斯凯是罗伯特朝自己开的枪。戈登劫持了神盾局的战舰，并且朝嘉颖开火。这一切激怒了斯凯，此时梅赶到，斯凯和梅动手。库尔森也十分困惑，他觉得罗伯特
